Možda najzanimljivija novost na novom iPhoneu 5S, Touch ID čitač otiska prsta, naizgled je idealno rješenje za sigurnost mobilnog uređaja. Iako je u reklamama i na samom predstavljanju prikazan u najboljem svjetlu, iz Applea su naknadno priznali da senzor nije idealan te da bi korisnici mogli imati određenih problema kod njegove upotrebe.
Naime, senzor ne prepoznaje dobro znojne i vlažne prste, kao ni prste prekrivene raznim kremama, losionima i sličnim tekućinama. Ovaj su nedostatak otkrili sami zaposlenici Applea prilikom testiranja. Osim odbojnosti prema vlazi na koži, Touch ID senzor je osjetljiv i na prste s ožiljcima od raznih ozljeda ili operacija. Korisnicima u tom slučaju preporučuju korištenje nekog drugog prsta za identifikaciju.